Model 4 analysis
Benjamin Mercier
Last updated on 05 October, 2022
Model 4
Description of the model
This fourth model is a new variation. It still compute the mass-action on the numerator, but attempts to make the flux saturate with the part on the denominator with the part of \(1 + {...}\), where we use handling time and the whole biomass consumption of the predator. \[\begin{align}
F_{ij}^{real} = \frac{F_{ij}^{theoretical}}{1+h_j * \sum_{i=1} ^{i}{F_{j}^{theoretical}}} && F_{ij}^{theoretical} &= \alpha_{j} * B_i * \frac{B_j}{M_j} \\
\end{align}\]
où
- \(\alpha\) est un paramètre spécifique à un prédateur (mais le prédateur peut se retrouver dans plusieurs réseaux différents)
- \(B_i\) est la biomasse de la proie dans un réseau spéficique
- \(B_j\) et \(M_j\) sont la biomasse et la bodymass d’un prédateur spéficique. La biomasse du prédateur est la même dans un réseau, mais peut varier d’un réseau à l,autre, alors que son bodymass sera le même pour chacun des réseaux.
- \(h_j\) est une variable déjà calculée.
## Warning: `gather_()` was deprecated in tidyr 1.2.0.
## Please use `gather()` instead.Exploring parameters posterior distribution
General parameters
Respective predator alphas
Respective predator handling times
Rhats
Examining Rhats to see if all parameters have converge
